正解！

正解は「長野県」。長野県内の遺跡で発掘され、国宝に指定されたのは「仮面の女神」「縄文のビーナス」の2つの土偶です。ちなみに「仮面の女神」は中ッ原遺跡、「縄文のビーナス」は棚畑遺跡からそれぞれ出土。どちらも長野県茅野市にある遺跡ですが、直線距離で4km弱離れているそうです。

なお、国宝に指定されている残りの土偶は「縄文の女神」（山形県）、「中空土偶」（北海道）、「合掌土偶」（青森県）の3つです。