胃以外のGISTのステージ分類
小腸、結腸、直腸、腹膜など胃以外に発生するGISTでは、胃GISTに比べて転移・再発のリスクが高く、悪性度がやや高いとされています。そのため、同じ条件の腫瘍でも、胃以外のGISTの方が高いステージに分類されます。
GISTのステージ分類を知るための検査方法
ステージ分類を決めるには、腫瘍の広がり（大きさと転移の有無）や細胞の増殖度合いを正確に把握する必要があります。そのためにさまざまな検査が組み合わされます。
内視鏡検査
胃や大腸内の粘膜面を直接観察する検査です。GISTは粘膜下にできる腫瘍のため、普通の内視鏡では表面の一部を採取しても診断が難しいことがあります。しかし、超音波内視鏡（EUS）を併用すると腫瘍の内部構造を調べたり、針を刺して組織を採取（生検）したりすることが可能です。胃の粘膜下腫瘍として指摘された場合、EUS下生検やCTガイド下生検によって組織を取り、病理診断でGISTかどうか確定します。
画像検査
身体の断面画像を撮影することで、腫瘍の位置・大きさや他臓器への転移の有無を詳しく調べます。CT検査では造影剤を使って血流や臓器の様子を映し出し、MRIでは軟部組織の描出に優れます。これらにより腹腔内の肝転移や腹膜播種、小腸など他部位の病変を見落とさないようにします。PET検査が行われることもありますが、まずはCTやMRI検査を行うのが一般的です。
病理検査
生検や手術で採取した腫瘍組織を顕微鏡で調べ、GISTであることを確認します。KITタンパクやDOG1タンパクなどの免疫染色によってGISTと診断されます。さらに、病理検査では腫瘍細胞の分裂像の数（有糸分裂率）を数えて悪性度を評価します。この分裂像数は再発リスクの評価にも用いられ、後述のリスク分類に欠かせません。また、近年では遺伝子検査でKITやPDGFRA遺伝子変異を調べ、薬物療法の効果予測や予後予測に役立てることもあります。
