セパン・インターナショナル・サーキットでMotoGP第20戦マレーシアGPの予選が行なわれた。ポールポジションを獲得したのはドゥカティのフランチェスコ・バニャイヤだった。
マレーシアGPの予選グループ分けでは、直近のレースウィナーとなるラウル・フェルナンデス（トラックハウス）、フェルミン・アルデゲル（グレシーニ）、バニャイヤらがQ1スタート。ここに小椋藍（トラックハウス）とマルコ・ベッツェッキ（アプリリア）も加わってQ2進出となる上位2枠を争うこととなった。
Q1ではまず1分57秒台中盤のタイムが記録されていき、暫定トップタイムとなったのは1分57秒536をマークしたホンダのルカ・マリーニだった。彼の後ろには僅差でアルデゲル、バニャイヤそしてフェルナンデスとウィナー達が続いた。
暫定3番手のバニャイヤはQ2後半のアタックで、一気に1分57秒190までタイムを更新。暫定トップに立った。
そんなバニャイヤに迫ったのがアルデゲル。0.042秒とわずかながらバニャイヤのタイムを更新し、暫定トップとなった。さらにアルデゲルは続けてアタックに入ったものの、ターン4でフロントを切れ込ませてクラッシュ。それ以上のタイム更新はできなかった。
Q1終盤はアルデゲルとバニャイヤを超えるペースを発揮するライダーはでなかったため、このふたりがQ2に進出した。小椋は最終的にトップから0.886秒差の7番手タイムで予選を終えた。
なおアルデゲルは自走でパドックに戻ったが、マシンを止めようとした際に減速が不十分でピット裏の棚に衝突。不要なダメージをマシンに与えてしまった。
ポールポジションの決まる予選Q2では、最初から1分57秒台前半のタイムが記録された。今週末好調なペドロ・アコスタやホンダ勢が上位タイムを刻んでいった。
Q2前半はアコスタがマークした1分57秒363が暫定トップとなっている中、少しタイミングをずらしてアタックしたファビオ・クアルタラロ（ヤマハ）が1分57秒195をマーク。これがトップタイムでセッション折り返しとなった。
またQ1を突破してきたバニャイヤは序盤をガレージ内で待機し、残り8分を切ってからコースイン。クリーンなコースでアタックに入ったバニャイヤは1分57秒001をマーク。バニャイヤはこのタイムでセッション終了を待つこととなった。
バニャイヤを脅かすペースを見せたのはアレックス・マルケス（グレシーニ）だったが、0.016秒とわずかに届かず2番手にとどまった。
残るライダーの中ではクアルタラロがセクター2まで最速タイム更新ペースを発揮していたものの、後半セクターでの伸びが足りず4番手……他に迫るライダーはいなかったため、バニャイヤがマレーシアGPのポールポジションを獲得した。2番手はマルケス、3番手はフランコ・モルビデリ（VR46）だ。
